O terreno reservado a implantação da nova sede da Fiocruz Amazônia está situado entre a 12ª Circunscrição Judiciária Miliar e o 1° Batalhão de Infantaria de Selva Aeromóvel, na Avenida São Jorge, bairro São Jorge, Manaus-AM.

Prédio será destinado para a Nova Sede, com áreas laboratoriais com classificação de nível de biossegurança 2 (NB-2), ensino, pesquisa e gestão. A edificação deve atender as atividades desenvolvidas pela instituição que deve ampliar a sua capacidade instalada e, consequentemente, a oferta do número de ensaios realizados, de profissionais capacitados em saúde pública e de atividades de pesquisa de relevância para as áreas de saúde pública e de ciência e tecnologia em saúde.

A principal edificação é composta por um bloco de laboratórios, distribuído em 6 pavimentos, sendo 1 pilotis de estacionamento, 3 de laboratórios e 2 pavimentos técnicos. Um segundo bloco de pesquisa, ensino e gestão distribuído em 4 pavimentos, sendo o térreo reservado para um ambulatório, biblioteca e restaurante, 1 pavimento de ensino com seis salas de aula, sala de exposições e uma secretaria acadêmica, 1 pavimento de gestão com escritórios e 2 de pesquisa com gabinetes e áreas de estudo. Estes blocos serão conectados por um braço central de 5 pavimentos, por onde é feito o acesso controlado ao prédio e onde estão instalados os elevadores e áreas comuns.

No fundo do terreno, ligado ao bloco de laboratórios estará o bloco de apoio logístico, que contará com uma área de depósitos com carga e descarga, refeitório, vestiário, e gestão predial, central de resíduos e áreas técnicas. O bloco de laboratórios, assim como o bloco de pesquisa, ensino e gestão, permitirão uma possíveis ampliações futura.

Além disso o projeto recebe certificação ambiental com Selo AQUA e Procel.